保山地处横断山系的滇西纵谷区南段，西南迎热带海洋孟加拉湾，为西南暖湿气流的通道；东部受西北——东南走向的云岭、无量山、哀牢山、乌蒙山等山脉的阻挡，西北有东西横亘著称“世界屋脊”的青藏高原屏障，北方南下冷空气不易侵袭本市；形成了复杂多样的自然地理环境。境内山脉和河流主要为南北走向，三大山脉（高黎贡山、怒山、云岭）之间，相列三大水系（伊洛瓦底江水系、怒江水系、澜沧江水系），高黎贡山、怒江纵贯全境，对保山市气候产生深刻的影响。全市地势呈北高南低，高黎贡山大脑子峰海拔3780.9米，为最高点，万马河口海拔535米，为最低点。地势起伏相差悬殊，垂直分层明显。